O colegial Yuu e seu amigo Haru se envolvem em um caso envolvendo seu amigo de infância Kotona, o que os obriga a ir e vir entre outro mundo que é diferente, mas é um pouco semelhante ao seu mundo, Ni no Kuni. O mundo real e Ni no Kuni, quando a vida de Kotona está em perigo, qual é a escolha final que os três têm que fazer em Ni no Kuni?